目前課程: 生物晶片   課程代碼: U_B20311A   聊天室 Site map
 
 
 
 身分:參觀者     姓名:guest
 
 
課程名稱 生物晶片
面授地點 s222
面授時間 (四)  234
課程目標 •        We  will  start  this  course  with  general  introduction  to  biochip  technology  including  protein  chip,  DNA  chip,  cell  chip,  lab-on-a-chip,  bio-MEMS,  biosensor,  micro/nano  mechanics,  and  microfluidics  used  in  the  genomics,  proteomics,  bioinformatics,  medical  diagnostics,  environmental  monitoring  and  micro/nanotechnology.  Then,  we  will  touch  more  on  the  different  aspects  of  DNA  microarrays  as  the  application  model  of  the  high-throughput  screening  technology.  
課程綱要 1.          Introduction  to  biochips
2.          Introduction  to  microarrays
3.          Affymetrix  GeneChip  system
4.          Genotyping  systems
5.          Image  analysis
Overview  of  data  analysis
6.          Experimental  design
7.          Reporting  results
8.          Basic  statistics
9.          Preprocessing  of  data
Normalization
10.          Midterm  exam
11.          DR  Chip  demonstration
12.          Finding  differentially  expressed  genes
Cluster  analysis  of  microarray  information
13.          Gene  regulatory  networks
Data  mining  for  promoter  sequences
14.          Biological  sequence  annotations
15.          Software  issues  (i)
16.          Software  issues  (ii)
17.          Software  issues  (iii)
18.          Final  exam
評量標準 30%  (作業+小考+出席率)+30%  midterm  exam  +  40%  final  exam  
參考書籍 教材(Course  Materials):
“DNA  Microarray  Data  Analysis”  2nd  Edi.,  2005.  Authors  Iiris  Hovatta  et  al.,  Publisher:  CSC,  the  Finnish  IT  center  for  Science.  [free  download]  http://www.csc.fi/csc/julkaisut/oppaat/arraybook_overview.

參考書(References):  
1.        "A  Primer  of  Genome  Science  "  2nd  Edi.,  2004.  Authors:  A  Primer  of  Genome  Science.  Publisher:  Sinauer  Associates.  ISBN:  0878932364.  藝軒圖書代理,  02-2367-6824,  www.yihsient,com.tw
2.        “Discovering  Genomics,  Proteomics  and  Bioinformatics”  2nd  Edi.  2006.  Authors:  A.  Malcolm  Campbell,  Laurie  J.  Heyer.  Publisher:  Benjamin  Cummings.  ISBN:  0805382194.
3.          "Guide  to  Analysis  of  DNA  Microarray  Data"  2nd  Edi.,  2004.  Authors:  Steen  Knudsen.  Publisher:  Wiley-Liss.  ISBN:  0471656046.  
4.        Online  books  at  NCBI  Bookshelf  (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=books)  
5.        Online  encyclopedia  at  Wikipedia  (http://www.wikipedia.org/)

修課條件
附件 生物晶片 授課大綱.doc